Nhân Chứng Giê-hô-va đã có mặt ở Kyrgyzstan từ năm 1956 và được công nhận về pháp lý vào năm 1998. Dù trong quá khứ từng phải đối mặt với sự đàn áp dữ dội về quyền tự do tôn giáo nhưng gần đây họ đã được nhà nước bảo vệ nhiều hơn về các quyền hợp pháp của họ.

Vào tháng 11 năm 2013, Tòa án Hiến pháp nhất trí phán quyết rằng những điều luật của Kyrgyzstan về nghĩa vụ thay thế là trái hiến pháp và đã chỉ thị cho chính phủ sửa đổi luật. Các tòa án của Kyrgyzstan đã tuân theo phán quyết của Tòa án Hiến pháp và từ đầu năm 2014, các anh Nhân Chứng không còn bị bắt bớ vì từ chối tham gia nghĩa vụ quân sự. Vào ngày 29-6-2015, Kyrgyzstan đã sửa đổi luật về nghĩa vụ quân sự để cho phép những người từ chối tham gia vì cớ lương tâm thực hiện nghĩa vụ dân sự thay thế mà không chịu sự kiểm soát của quân đội.

Vào tháng 9 năm 2014, Tòa án Hiến pháp phán quyết có lợi cho Nhân Chứng Giê-hô-va và quyền tự do tôn giáo khi tuyên bố rằng một phần trong bộ luật năm 2008 về tôn giáo là trái hiến pháp. Tuy nhiên, Ủy ban Tôn giáo Nhà nước đã lờ đi phán quyết của Tòa án Hiến pháp và từ chối công nhận tổ chức tôn giáo của Nhân Chứng tại địa phương ở các vùng phía nam của đất nước. Việc Nhân Chứng không được công nhận như thế khiến một số chính quyền xem hoạt động của họ là bất hợp pháp. Dù vậy, khi Nhân Chứng đến gặp các viên chức để xóa bỏ hiểu lầm thì họ thường có thể được phép nhóm lại để thờ phượng và chia sẻ niềm tin của mình cho những người xung quanh mà không bị cản trở. Nhân Chứng mong rằng chính phủ sẽ hoàn toàn tuân theo phán quyết của Tòa án Hiến pháp và công nhận tổ chức tôn giáo của họ là hợp pháp ở miền nam Kyrgyzstan.